高效毛細管電泳色譜儀簡稱毛細管電泳儀（CE），是以毛細管為分離通道，以高壓直流電場為驅動力，利用荷電粒子之間的淌度差異和分配系數差異進行分離，是分析科學繼高效液相色譜儀之后的又一重大進展，使分析科學從微升級進入到了納升級水平，不僅使單細胞乃至單分子分析成為可能，也使蛋白質和核酸等生物大分子分析有了新的轉機。目前，生命科學領域的分析儀器正向著微型化、集成化和自動化的方向發展，高分辨率、快速、耗樣量少、低成本和高通量的毛細管電泳的應用前景將會非常廣闊。

一、使微量PCR擴增及產物檢測整合成自動化體系：

微型硅膠PCR反應器與CE芯片可整合成DNA分析系統。β－球蛋白基因在15min內可從M13中擴增出來，然后在120s內在CE芯片上得到快速分離，使整個PCR－CE過程在20min內完成。而且從毛細管的出口處可收集經過分離純化的DNA片段，該片段可轉移到正電荷膜上進行雜交。此方法可代替和簡化傳統的DNA片段回收方式，自動化程度高，分離純度高。此外，由于毛細管出口小，片段易于在雜交膜上富集，皮克級DNA都能經雜交檢測到。這使PCR擴增、CE分離純化和DNA雜交三個過程實現集成化和系統化成為可能。

二、使高通量DNA分析和測序成為可能：

放射性陣列毛細管電泳微板與掃描儀聯用可實現高通量的DNA檢測。電泳微板包括一個普通中央陽極槽，與96個微型分離通道相連，使用激發的旋轉共聚焦掃描檢測器檢測四色通道，96個樣品采用壓力式毛細管陣列系統平行進樣，可使96個PBR322限制性內切酶片段在120s內得到高效分離。若同時使用40塊微板，每塊微板上有384個分離通道，則一次進樣量可達15000個，從而達到高通量DNA分析和測序的目的。此外，CE不僅可對DNA的合成片段進行純度檢驗，對PCR擴增的DNA模板進行純化和從反應體系中去除，還可進行文庫建立或復制，啟動子作用方式檢測自然和人工合成RNA的結構。

由于CE開發和應用的歷史不如色譜長，對于各種不同物質的分離技術和方法還不夠完善和成熟，在實際分析過程中需要花較長時間放在方法的建立上。

   

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